W skład Samodzielnego Publicznego Ośrodka Rehabilitacyjno-Terapeutycznego dla Dzieci i Młodzieży wchodzą:

1. poradnie specjalistyczne,
2. dział fizjoterapii,
3. dział terapii psychopedagogicznej,
4. ośrodek rehabilitacji dziennej,
5. ośrodek rehabilitacji dziennej dla dzieci i młodzieży,
6. sekcje i samodzielne stanowiska pracy.

Strukturę organizacyjną Ośrodka oraz tryb działania i zadania poszczególnych komórek określa Regulamin Organizacyjny.